Le Comité Exécutif est élu, comme la Co-Présidence, pour une période de trois ans. Avec la Co-Présidence, le CoEx prépare les grandes orientations de politique pour l’AG, assure la mise en œuvre des résolutions adoptées par l'Assemblée Générale (AG) et dirige la Conférence européenne entre les sessions annuelles de l’AG.
Les postes dans le CoEx comprennent la Co-Présidence, le Secrétaire Général, tous membres d’office, ainsi que 4 à 7 autres membres de Commissions nationales dûment élues. Le CoEx se réunira au moins trois fois par an. Le CoEx doit représenter la diversité de la Conférence européenne. Le Comité exécutif (CoEx) est autorisé à publier des déclarations en son nom propre.
H.E. Mgr Antoine Hérouard, Co-Président (Archevêque de Dijon, France)
Maria Hammershoy, Co-Présidente (Danemark)
Stefan Lunte, Secrétaire Général, E-Mail: secretary@jupax-europa.org
Zsanett Bánlaki (Hongrie)
Ton Broekman (Espagne)
Gertrud Casel (Luxembourg)
Daniel Darmanin (Malte)
Bernd Hirschberger (Allemagne)
Marek Mišák (Slovaquie)